Die in Schachtinsk (Kasachstan) geborene Margarita Wiesner kam 1993 nach Deutschland und wuchs in Sachsen auf. Bevor sie das Schauspiel-Studium an der Staatlichen Hochschule für Musik und Darstellende Kunst in Stuttgart aufnahm, hatte sie bereits an der TU Dresden bis zur Zwischenprüfung Slavistik und Angewandte Linguistik studiert.
Während ihres letzten Studienjahres an der Stuttgarter Schauspielschule verstärkte Margarita Wiesner als Elevin in der Spielzeit 2010/2011 das Ensemble des Landestheaters Tübingen und war dabei unter anderem in »Der Diener zweier Herren« (Regie: Michael Helle) sowie in »Gespräche mit Astronauten« (Regie: Marion Schneider-Bast) zu sehen, wofür sie von Theater heute als beste Nachwuchsschauspielerin nominiert wurde. Nach Abschluss ihres Schauspielstudiums trat Margarita Wiesner zur Spielzeit 2011/2012 ihr erstes Festengagement an der Württembergischen Landesbühne Esslingen an.
2013 wechselte sie wieder ans LTT. Außerdem arbeitet sie als Sprecherin für den SWR 2. Seit 2014 arbeitet sie freischaffend im Raum Stuttgart.
Am Zimmertheater spielt sie in Cabaret, und in Raub der Europa die Rolle von Anna.